第一步：排除嗜碱性粒细胞假性下降；
第二步：确定有无嗜碱细胞反应性下降的相关表现（或癌症），或有无血液肿瘤相关信息；
第三步：排除假性下降/嗜碱细胞反应性下降/CML癌症以后，进行二线检测（包括骨髓核型剖析、分子学检测）以筛选Ph—MPN、MDS、AML、嗜碱性粒细胞白血病。
一、嗜碱细胞是真下降吗？
（一）血细胞分析仪：临检工作中常碰到血球分析仪器得到的嗜碱细胞比列出现假性下降情况，这与血球仪器采用嗜碱细胞不同测量原理相关。如库尔特与美赞臣仪器采用共同白细胞分类通道，联合激光散射与多种方式（如阻抗、光吸收等）将嗜碱细胞与其他白细胞进行分辨检查。而其他仪器如希森美康，迈瑞，西门子等采用专用溶血剂通道，利用嗜碱细胞较其他类型白细胞更难溶化的方式来进行分辨检查。最近库尔特采用称为“血球流式”方法用特殊的抗体标记检查嗜碱细胞。尽管仪器搜集剖析细胞量之大，结合技术革新，但对嗜碱细胞确切计数而言仍有待建立。
临床上遇见嗜碱细胞假性下降情况少于假性降低。常见诱因剖析：
嗜碱细胞假性下降多见于3个缘由：1.样本超过24h进行检查可能与嗜碱细胞重度下降相关；2.嗜碱细胞专用通道检查时，某些情况下因其他白细胞（异形淋巴、浆细胞、淋巴瘤细胞、原始细胞）耐受溶血剂的破坏，导致其被计数为嗜碱细胞；3.白细胞共同通道检查时，一些脱颗粒的中性分叶核细胞、有核红细胞、聚集的血小板会分布于嗜碱细胞散点图位置，导致嗜碱细胞假性下降。
嗜碱细胞假性降低的2个缘由：1.嗜碱细胞专用通道时，因嗜碱细胞被溶血剂破坏，导致该通道嗜碱细胞数目增长；2.白细胞共同通道时，仪器剖析病变性嗜碱细胞的特点，将其归类分布于中性粒细胞区域，从而计数为中性分叶核细胞，导致假性降低。
国际实验血液学学会（ISLH）建议初次嗜碱细胞结果>0.5 × 109/L（>500/uL）的样本须要进行人工显微镜镜检复核；嗜碱细胞
临床实验室标准化委员会（CLSI）H20-A2文件嗜碱细胞参考方式是血涂片手工显微镜分类（计数400个白细胞得出嗜碱细胞比率）。该法存在问题：a活检上细胞分布不均匀；b形态学人员对嗜碱细胞形态分辨能力差别；c方式固有形成的统计学误差。对低值嗜碱细胞样本中统计学误差的问题尤为严重，通过降低计数总数的血球仪器可能会填补这一问题。而对“血球流式法”也有试验进行了评估，但不同研究者得到推论不尽相同，其真实价值有待进一步明晰。
（二）血涂片检查
血涂片用于嗜碱细胞分类计数、评估细胞形态及为临床提供血液肿瘤提示信息。如上图左一为正常的嗜碱细胞；右三图为异常嗜碱细胞，特点为脱颗粒、颗粒染色/大小异常、胞浆空泡、核分叶过多、幼稚阶段。反应性嗜碱细胞下降以颗粒降低为主，其他异常形态改变稀少。而MDS与CML加速期常出现其他的异常形态。
手工分类应计数起码400个白细胞。手工分类与仪器结果出现不一致时，推荐额外进行200个细胞计数。因手工方式比较历时，受各实验室人员经验等影响，即使计数600个细胞，对于1%界值的嗜碱细胞比率，95%置信限可靠性仍不足。而采用血细胞图象剖析系统可在较短时内充分计数足量的细胞数，这是有一定的帮助价值。
（三）流式检测
流式SSC/CD45，嗜碱细胞CD45抒发较弱，介于淋巴细胞与原始粒细胞之间。嗜碱细胞以作为一个较特异的表面标记；也有报导觉得CD193与CD123具有最好的鉴定能力等等。比如嗜碱细胞不抒发CD34、DR、CD117，以此区别于原始粒细胞。
二、嗜碱细胞相关的非癌症性疾患
嗜碱细胞下降的疾患：过敏性鼻炎；缺铁性贫血与重度嗜碱细胞下降；糖尿病病人较非糖尿病病人嗜碱细胞高；某些感染与嗜碱细胞下降相关；嗜碱细胞下降与结核/水痘/肝硬化；文献报导乳腺功能降低与寄生虫感染（但一项668位寄生虫感染的研究显示与未感染者之间没有统计学差别；1993年一项甲减的研究也未发觉甲减与健康人群间的差别）。
嗜碱细胞减少的疾患：慢性荨麻疹；抑郁/焦虑；皮质激素水平下降相关。
三、嗜碱细胞相关的病变性疾病
1. CML 嗜碱性粒细胞下降是CML最常见的外周血异常表现之一。部分CML嗜碱细胞下降可能是单独惟一的表现，且维持数月之久；甚至在极罕见情况下持续数年下降。等人报导一例80岁CML病人，长期随访（27个月）出现单一嗜碱细胞下降，而无癌症进展表现。嗜碱细胞数目在CML 中下降程度不一，但数目>1 × 109/L（1000/uL）需要高度怀疑CML可能。次要破裂点m-BCR型甚少出现嗜碱细胞下降与脾大。嗜碱细胞下降是独立的预后诱因，高嗜碱细胞病人生存期较短。WHO/ELN也将嗜碱细胞比列小于20%作为CML加速期的指标。
2. 其他血液肿瘤
排除反应性嗜碱细胞下降或CML后，需要进行二线筛查，包括分子学、骨髓形态学评估与细胞遗传学检测。
嗜碱细胞下降病人中筛查BCR-ABL1, JAK2, 和或 CALR基因，重排阳性率分别为84.7%，15.2%，12.5%。后三者为Ph—MPN，如PMF、ET、PV。PMF病人中嗜碱细胞低于正常对照，其中1/2病人出现嗜碱细胞>0.1 × 109/L。ET、PV病人中嗜碱细胞可呈轻度下降。有时仅凭验血结果很难分辨CML与Ph—MPN，PMF可出现脾大、白细胞、血小板升高等类似CML表现；PV伴贫血时，压积常正常、伴血小板与白细胞下降。一些CML也可出现血小板下降伴嗜碱细胞重度下降淋巴细胞比率偏高的原因，与ET鉴定困难。因此须要分子检测用于Ph—MPN确诊。
约15% MDS病人出现骨髓嗜碱细胞下降，其中42%病人出现嗜碱细胞>0.1 × 109/L。无论采用0.1 × 109/L或>0.25 × 109/L作为嗜碱细胞下降的界值，嗜碱细胞下降与MDS总体生存率负相关，而与MDS转白之间尚无统一共识。MDS病人外周血出现高嗜碱细胞，常与特殊染色体异常相关，如i（17q），t（6；9）和复杂核型。嗜碱细胞轻度下降还可以见于MDS/MPN，如CMML，或aCML。
嗜碱细胞下降尚见于慢性嗜碱细胞癌症，CML急性期，AML伴嗜碱细胞下降，以及急性嗜碱细胞肺癌。AML伴嗜碱细胞下降常出现一些特殊的染色体异常，如t(6;9)(p23;q34)，t(8;21)(q22;q22), t(X;6)(p11;q23)和12p异常。
急/慢性嗜碱细胞癌症以嗜碱细胞下降为特征，除CBL的特性（2017年国际专家组CBL确诊标准共识：嗜碱细胞增高>1 × 109/L 8周，PB或BM嗜碱细胞比列小于40%，伴嗜碱细胞恶性克隆证据）外，急性嗜碱细胞肺癌原始细胞小于20%。
淋巴瘤伴嗜碱细胞下降非常罕见淋巴细胞比率偏高的原因，有学者报导一例初发CD5+淋巴瘤病人嗜碱细胞下降的案例。但嗜碱细胞下降并非是大夫确诊淋巴瘤的重要提示。