1.继发感染 大约10%到30%的肝包虫囊肿会继发于细菌感染。病原菌主要来自胆管系统。囊肿压迫周围的肝组织并随着逐渐增大而形成纤维囊。肝脏中的小胆管通常被压缩并包裹在纤维囊中。这些小胆管可以破裂进入囊腔。一般认为，80%的肝包虫囊肿和肝内胆管有明显或隐匿的交通瘘管，病原菌随胆汁通过瘘管侵入囊肿而被感染。继发感染后肝包虫囊肿的典型三联征包括寒战、高热、肝区持续疼痛和囊肿在短时间内迅速增加。囊肿迅速增大，使周围器官受压症状更加明显，如外力挤压、局部振动或穿刺不当，易破裂。实验室检查显示白细胞增多，可能伴有贫血； B囊壁增厚，囊内回声不均匀，可见不规则的高回声肿块； CT扫描时，囊液CT密度值升高，囊内可出现气体，并伴有囊周组织水肿。临床应重视肝脓肿的鉴别。
2.囊肿破裂 国内文献报道各种原因导致肝包虫囊肿破裂的几率为12.9%。囊肿可自发破裂，尤其是继发感染后。由于炎症刺激，囊液急剧增多，囊内压升高，破裂的机会更大。一些外伤因素（如穿刺、挤压等）可导致囊肿破裂。囊肿可破裂至不同部位并引起相应的临床症状。
(1)胆管破裂：这是最常见的并发症，约占5%~10%，可损伤肝外胆管和胆囊，但大部分可损伤肝内胆管。胆管破裂的因素是囊肿压迫胆管壁肝棘球蚴病，导致胆管壁局部坏死，胆绞痛、黄疸、荨麻疹三大主要症状应与胆石症鉴别，囊性内容物阻塞胆管，尤其是囊肿感染者，可引起急性阻塞性化脓性胆管炎。
(2）进入腹腔：位于肝脏表面的昆虫包囊很容易进入腹腔。破裂后，包囊内容物（包括囊液、asc和原头）进入腹腔，引起突然腹痛和过敏性休克，腹部包块可突然缩小或消失。囊液进入腹腔可引起不同程度的腹膜刺激症状，如囊原与胆管相连，胆汁进入腹腔可引起严重的胆汁性腹膜炎。感染的囊肿破裂进入腹腔可引起严重的胆汁性腹膜炎。引起弥漫性腹膜炎。腹膜腔炎症明显导致原发性头部肿瘤死亡肝棘球蚴病，留下肉芽肿，但更常见的是原发性头部肿瘤存活数年后发展为多个囊肿，称为腹膜继发性棘球蚴病 肝包虫囊肿进入引起的急腹症腹腔应与其他原因引起的急腹症相鉴别。
(3）胸廓破裂：位于肝横膈顶部的包虫囊肿，尤其是继发感染后，可穿透横膈使胸腔破裂，引起急性胸腔积液和过敏反应，通常在右侧胸腔。胸腔囊肿破裂常伴有阵发性剧烈咳嗽和刀割胸痛。囊肿是炎症引起的——膈肺粘连，囊肿可直接破入支气管，形成囊肿——如果囊肿与支气管相连胆管，形成一个胆管瘘——支气管瘘。早期有咯血泡沫痰，后期咳出痰中含有胆汁、囊液、腹水和内部囊肿碎片，少数患者可能会窒息。
(4)腹壁穿孔：肝包虫囊肿继发感染后可粘附腹壁，穿刺腹壁自塌，囊液及囊内容物流出体，形成一个持久的腹壁窦。
(5)闯入心包腔：位于肝左叶的包虫囊肿可穿透隔膜进入心包腔，引起急性心包填塞。
(6)肝静脉破裂：少数肝包虫囊肿可使肝静脉破裂，囊内容物进入肝静脉可引起肺栓塞。