（性别分化在胚胎 12 周之前在临床上并不明显）：性别分化取决于睾丸决定因素和雄激素。

性腺分化：胚胎6周后，原始性腺开始分化。Y染色上有一个Y基因决定区，编码睾丸决定簇（-发育不良，TDF）。TDF通过相应的转运，一方面导致性腺皮质的退化，另一方面导致性索细胞的转化，最终促进睾丸的形成；如果胚胎细胞不含Y染色体，不利于睾丸的形成，大约12周的胚胎，原始性腺发育，原始后生殖细胞分化，最后形成卵巢。

内生殖器退化：支持细胞可分泌一种糖蛋白，即副中肾管抑制因子（mü，MIF），可使副中肾管退化并启动间质细胞分泌睾酮。在中肾管中分化为输精管、附睾、射精管和精囊。如果中肾旁管不退化，在胚胎第9周，双侧中肾旁管上段形成输卵管，下段融合，它们之间的纵向间隔消失，形成子宫阴道管，即与下泌尿生殖窦相连形成阴道。

外生殖器发育：内生殖器分化的同时，在体内睾酮的调节下发育不良，生殖器结节分化为阴茎，泌尿生殖器皱襞融合闭合，阴囊隆起发育为阴囊；如果体内没有睾酮，生殖器结节增大，形成阴蒂，而泌尿生殖褶皱形成小阴唇，阴囊隆起发展为大阴唇。